Kind: captions
Language: id
Hai assalamualaikum warahmatullahi
wabarakatuh di video kali ini Mari kita
pelajari Bagaimana caranya mengakses
Jane Bang kemudian mencari nukleotida
yang kita inginkan serta mengunduhnya
dalam format fakta langkah pertama yang
harus kita lakukan adalah kita mengakses
Google terlebih dahulu kemudian di Kolom
pencarian Google kita ketikkan ncbi ncbi
Kenapa karena jayne bank merupakan
database yang dikelola oleh NTB NTB
sendiri merupakan singkatan dari
National Center for biotechnology
information suatu cabang dari institusi
kesehatan di Amerika
Hai setelah hasil pencarian muncul
kemudian kita pilih situs yang pertama
yang paling atas dari hasil pencarian
Google ini kita klik kiri sekali
Hai setelah kita klik kiri sekali maka
kita langsung diarahkan ke halaman utama
dari website ncd ini Apa langkah
selanjutnya nah di bagian atas sini ada
old debesis ini kita ganti ke nukleotida
atau nucleotide selain nukleat sendiri
disini kita dapat menemukan berbagai
database ya Ada jin di sini jin itu gen
ada jinom bahkan ada protein nah pada
video kali ini kita menggunakan
nucleotide
Hai setelah kita Ubah menjadi nucleotide
di Kolom pencarian kita bisa memasukkan
nama gamenya atau nama proteinnya dan
kadang kita juga bisa memasukkan nama
spesies beserta jenisnya sehingga hasil
pencariannya lebih fokus pada spesies
tersebut atau yang berkaitan dengan
spesies tersebut
Hai Pada kesempatan kali ini Mari kita
coba ya kita Tuliskan tanpa nama
spesiesnya misalkan Saya akan menuliskan
nama salah satu gen yaitu MT CO2
hai lalu saya klik search MTC otu ini
sebetulnya gen yang ada di mitokondria
sehingga ada MT nya sioto ini singkatan
dari sitruk sitokrom oksidase sub-unit
dua kalau kita belajar metabolisme ya
khususnya di bab karbohidrat dan
respirasi seluler ketika kita belajar
transport elektron pada saat fosforilasi
oksidatif kita akan mengenal adanya
protein enzim yang kita kenal sebagai
sitokrom c oxidase sub-unit dua Nah
gamenya Ini namanya adalah MTC otu
setelah kita mengklik search ya Maka
akan muncul hasil pencarian di sini
saat ini ada banyak ya karena kita tidak
menuliskan spesiesnya maka gen atau
nukleotida yang dihasilkan dari hasil
pencarian ini dari berbagai spesies ada
dari villosa lenosa ada dari Margaret
Fitri Vera hebel ada dari lam Sis Trump
ini ini nama-nama spesies ya menggunakan
binomial nomenklatur menggunakan dua
kata ya Nah kemudian di sisi kanan ini
ada Resort sebaik takson kemudian top
organism kemudian ada nama-nama spesies
Ketika kita memilih salah satu spesies
di sini makan nanti hasil pencariannya
berubah hanya menampilkan spesies yang
kita klik tersebut
Hai Nah sekarang misalkan saja ya kita
langsung pilih saja yang pertama ini
villosa linosa situ comse oksidase
segini 2 dalam kurung CEO tujin
Hai kemudian saya trik kiri sekali
I make setelah kita klik kiri sekali
maka kita akan diarahkan ke halaman yang
berisikan informasi terkait gen ini
Oh ya Ini tadi Nama lengkapnya kemudian
di sini ada tulisan jinbang mohon maaf
cinbeng aye 9519
Hai nah disini lokus juga ada
Hai simbol yang sama
Hai kemudian di sini ada aksesi apa
aksesi akses itu semacam KTP ID KTP
kalau bagi masyarakat Indonesia Nah sesi
atau akses Ndi Jin Bang ini sebagai ID
dari data game ini sedangkan logos logos
itu letak dimana genti ini ditemukan di
kromosom kita kalau belajar materi
genetik ya kita mengenal adanya lokus
lokus adalah daerah Dimana kita dapat
menemukan gen tertentu selain locus dan
action di sini ada tulisan 837 BB BB
tubis pir despair itu pasangan basa
satuan yang menunjukkan panjang dari
nukleotida DNA atau RNA nah disini
dikatakan 837 pasangan basah panjang
dari nukleotida didata ini
Hai kemudian disini ada tertulis
informasi DNA maka nukleotida ini
berasal dari DNA yang bentuknya linier
kalau kita belajar materi genetik ya ada
yang kromosom itu linier kebanyakan itu
di dieu karya ada juga yang sirkuler
misalkan kita kalau belajar materi
genetik di bakteri
Hai ataupun di mitokondria itu
sebetulnya sirkuler nah ini Kebetulan
linier
Hai kemudian di bawah ada definition
definisinya ini sama seperti judulnya
ini ya Ada nama gamenya kemudian ada
nama spesiesnya kemudian disini ada
keterangan parsial CDS dvds itu
singkatan dari coding scenes kalau kita
belajar gen ya di dalam game itu ada
daerah yang mengkodekan asam amino asam
amino ini kan hasil dari translasi yang
menyusun rantai polipeptida nah daerah
dari gen yang mengkode asam amino ini
kita kenal sebagai coding scan daerah
yang mengkode menggoda apa menggoda
protein atau polipeptida atau urutan
asam amino disini tulisannya parsial
bukan komplit artinya informasi atau
data Ini tuh hanya sebagian dari
keseluruhan gen tersebut Kalau komplit
jadinya keseluruhan gen tersebut
jadi data ini karena ini parsial hanya
dirinya hanya sebagian
Hai selanjutnya di sini ada source itu
sumber
Hai sumber Apa maksudnya sumber dari
data nukleotida ini diperoleh dari mana
Dari mitokondria milik Spesies ini Leon
Ulin linneus
Hai lale neolin usus ini termasuk
eukariot ya Dia metazoa kemudian disini
bisa kita ketahui dia ini ternyata
bivalvia termasuk modus kaya dia ini
kerang-kerang air tawar Kalau tidak
salah nanti Silahkan di search di Google
untuk memastikannya kemudian di sini ada
referensi-referensi itu
Hai semacam referensi yang mencantumkan
atau yang melaporkan squash nukleotida
kini jadinya Data Squad nukleotida ini
dikerjakan oleh guru les sama konser ini
bacanya apa ya Saya tidak tahu di
publikasinya yang berjudul ini Evolution
of you need me Mito tipe dan seterusnya
yang dipublikasikan di jurnal ini
hai kamudian
Hai di bagian bawah sini ada jin atau
gennya kemudian ada CDS atau codings
Kuenya apa maksudnya Nah misalkan ya
kita mencari data di jembeng kita bisa
saja mendapatkan rantai nukleotida yang
panjang kemudian kalau kita mengklik
jinnya makan nanti langsung diberitahu
di rantai nukleotida tersebut gennya
berada di mana Nah ini Kebetulan gamenya
ini menyeluruh dari bahasa pertama
hingga basah terakhir sehingga ketika
kita klik jin di sini kita klik gennya
maka terblok semua namun kalau rantai
nukleotida ini tidak semuanya terdiri
atas gen ketika kita klik jin di sini
hanya sebagian yang terblok hanya
sebagian dari
Hai nukleotida tersebut yang merupakan
game
Hai di bawah Ken atau jin di sini ada
CDS codings kuenya disini juga
keterangannya sama dari bahasa pertama
hingga 837 jadinya ketika kita klik PDF
Disini yang terblok juga sama semua
Hai namun bisa saja ketika kita mencari
gen tertentu Kita memperoleh suku esnya
misalkan 1000 pasangan basa ternyata CDS
nya itu hanya nomor 5 hingga 400
misalkan sehingga ketika kita klik CD
esnya yang terblok hanya sebagian juga
bahkan kalau data atau scans
nukleotidanya lengkap dan gen itu
diperoleh dari kromosom inti sel
eukariot misalkan makan nanti bisa saja
disini tidak hanya tulisan Jin CDS namun
di sini ada X1 x2 x3 Exxon sendiri Lu
bagian dari gen eukariotik yang
dipertahankan ketika proses translasi
Hai nanti kita akan pelajari di video
lainnya Maksudnya apa dan contohnya
seperti apa
Hai kemudian di bagian sini ada hasil
translasi ini translation sama dengan
ini apa maksudnya nih kalau kita belajar
materi genetik ya kita belajar genetika
ya Gan Itu kan
Hai kebanyakan DNA DNA itu lalu
ditranskripsi menjadi Erna kalau dia er
enaknya Messenger MrNa maka akan lanjut
ke translasi nah translasi ini membaca
MrNa yang hasil bacaannya adalah rantai
asam amino atau rantai polipeptida nah
hasil translasi dari gen tersebut
dicantumkan Disini
Hai dan sama ketika kita mengklik CDS
Nya maka basa nitrogen dari gen tersebut
terblok dan DC sini muncul hasil
translasinya ini sama sebetulnya
informasinya
Hai setelah kita klik CDS terblok
seperti ini akan muncul kotak seperti
ini kalau kita Ingin menutup kotak ini
ya sudah kita klik tanda panah di sisi
kanan diteliti untuk menghilangkan kota
ini begitu ya Dan kita lihat
Hai hasil transaksinya Disini yang
menggunakan huruf kapital gyy apa
sebetulnya ini merupakan singkatan asam
amino-asam amino itu kan ada 20 dan
setiap asam amino bisa disimbolkan
dengan satu huruf kapital Sesuai dengan
keputusan yang ditetapkan oleh para
ilmuwan
Hai saya lupa ya nama organisasinya
Jadinya kalau sama minumnya ini
simbolnya apa dan sebagainya sedangkan
pada rantai
Hai nukleotida ini kita lihat tulisannya
ggtg ate-ate nah ini perwakilan dari
basa nitrogennya kalau kita belajar DNA
DNA itu kan tersusun atas basa nitrogen
ada empat macam ada adenin guanin
sitosin dan timin adenin itu disingkat
sebagai A guanin g.tim itu TC itu
sitosin
Hai jadinya disini ditulis cukup basa
nitrogennya saja karena basa nitrogen
inilah yang mengandung informasi genetik
begitu nah sekarang bagaimana cara
mendownloadnya secara menurutnya mudah
kita kembali ke arah atas kemudian di
sini ada tulisan sentuh ya di sisi kanan
Send to ada tanda panah bawah kita klik
kiri sekali
Hai kemudian kita tetap pilih yang
komplit record kemudian jus definisinya
kita pilih file
Hai kemudian disini formatnya kita ubah
dengan cara mengklik tanda panah bawah
ini kemudian kita pilih fasta
Hai kemudian kita klik clipfail
hai lalu kalau browsernya Mozilla
Firefox akan muncul kotak konfirmasi
seperti ini kita pilih file kemudian
kita klik oke begitu akhirnya terseksi
Hai laptop kita masing-masing sekarang
saya contohkan satu lagi yang
informasinya sedikit berbeda misalkan ya
kita tetap menggunakan database
nucleotide kemudian disisi Kolom
pencarian kita Tuliskan miosin
Hai kemudian kita klik search n itu
protein yang bisa kita temukan di otot
ya bersama actin
Hai nah disini akhirnya muncul banyak ya
Hai misalkan saya pilih yang ini mati
nopet nvc nensis saya klik kiri sekali
Ya saya akan Tunjukkan informasi yang
berbeda ketika kita tadi melakukan
pencarian nukleotida dari gen MTC utuh
kita ingat bahwa informasi dari halaman
gen tersebut menyatakan dia DNA
Hai nah Kalo yang ini kita lihat
ternyata nukleotida yang diperoleh yang
menjadi dasar data di informasi ini
berasal dari MrNa jadinya peneliti itu
mengisolasi MrNa dari Spesies ini
Hai Mizu hoped NY soloensis atau Yesus
kalopo diadu termasuk
Hai Nah si peneliti yaitu hasegawa itu
melakukan isolasi materi genetik yang
diperoleh berupa MrNa
Hai namun yang menariknya kalau kita ke
arah bawah sini ya
Ayo kita lihat di sini urutan nukleotida
nya kita lihat Gea gcgc dan seterusnya
kemudian ada
yo yo ini kan MrNa MrNa tidak mengandung
timin tapi mengandung urasil tapi kenapa
urutan nukleotida nya disini yang muncul
adalah timin jawabannya adalah yang
dicantumkan disini merupakan fade nanya
apa itu cdna cdn itu singkatan dari kopi
di
Hai dari mana sih DNA didapatkan cdna
ini merupakan hasil transkripsi balik
dari Erna kalau kita belajar dogma
Sentral
Hai genetika molekular kita tahu ya DNA
itu bisa ditranskripsikan menjadi Erna
Erna sendiri bisa ditranskripsi balik
menjadi DNA nah ini merupakan hasil
transkripsi balik dari MrNa yang
diperoleh si hasegawa ini tapi
Hai kemudian ini juga ada informasi yang
menarik ya
Hai di sini panjang dari nuklir tidaknya
sebesar atau sepanjang 6061 beser atau
pasangan basa gennya itu seluruhnya
Hai dari bahasa pertama hingga 6061
namun codings kuenya hanya dari bahasa
ke-43 hingga 5880 sehingga ketika kita
klik nah yang terblok tidak semua hanya
bagian yang merupakan codings kuenya dan
sama seperti tadi sisi kanan ini akan
muncul urutan asam amino yang merupakan
hasil translasi dari daerah coding gini
yang informasinya sama dengan ini
Hai cara melakukan penyimpanan data ini
juga sama kita klik sentuh kemudian kita
pilih komplit record kemudian kita pilih
file lalu formatnya kita pilih pasta
lalu kita klik create file
Hai tinggalkan muncul kotak dialog
seperti ini kemudian kita pilih file
lalu kita klik ok
Hai Nah sekarang kita lihat Disini
Hai saya buka foldernya terlebih dahulu
Hai Nah untuk membuka format pasta ini
kita bisa menggunakan notepad ini
Kebetulan di laptop saya langsung ya
link knotted namun bagi Anda yang belum
bisa membuka langsung format pasta Anda
bisa melakukan Klik Kanan
Hai setelah Klik Kanan pilih Open which
Hai Nah setelah open with dicari
aplikasinya yaitu note Pep misalkan di
sini ada pilih moraapps nah kemudian
cari notpad kemudian klik ok
Hai nah ini merupakan hasilnya ini besar
ya saya perkecil dulu ukuran font dari
notpad saya
hai hai
Hai GM Ical kan ukurannya 11 nah ini ini
merupakan
Hai data dari suku-suku yang tidak kita
yang kita save dalam format pas tadi
Hai dan data ini nanti akan kita
lanjutkan sebagai dasar kita melakukan
analisis band formatika di video
selanjutnya yaitu melakukan belas terima
kasih atas perhatiannya Mohon maaf bila
ada kesalahan Assalamualaikum
warahmatullahi wabarakatuh