Tutorial Cara Melakukan Multiple Sequence Alignment menggunakan Clustal Omega
1dUyr3nMXS0 • 2021-04-08
Transcript preview
Open
Kind: captions
Language: id
Halo assalamualaikum warahmatullahi
wabarakatuh di video Sebelumnya kita
telah mempelajari bagaimana caranya
melakukan Blast dan di video tersebut
kita bisa melihat hasil lain Man Ia yang
menunjukkan bahwasanya di Blast kita
hanya bisa melakukan penjajaran dua
squash nuklir Tidak sehingga
penjajahannya hanya sepasang-sepasang
antara dua nukleotida tidak bisa lebih
dari dua Nah pada video kali ini Mari
kita pelajari Bagaimana caranya
melakukan multiple lines caranya
melakukan penjajaran pada lebih dari dua
Square langkah pertama yang harus kita
lakukan adalah kita mengakses Google
terlebih dahulu setelah Google
tertampilkan di Kolom pencarian Google
Mari kita ketik class telur Omega 1
Hai nah di hasil pencarian yang paling
atas akan diperoleh hasil ini Kalsel
Omega kemudian ini ada multiple scan
selain Man ini yang kita klik klik kiri
sekali
Hai sehingga kita akan diarahkan ke
website dari kelas lo
Hai Sekarang mari kita lakukan multiple
scan salin
Hai caranya bagaimana nah disini sudah
ada panduannya step Pertama masukkan
squash kita
Hai kemudian disini ada pilihan sequins
kita ini protein DNA atau RNA pada video
kali ini Mari kita pelajari Bagaimana
caranya melakukan multiple scan selain
menpa data DNA sehingga kita pilih yang
DNA
Hai kemudian di kolom squishy nenis
support format disini kita bisa mengkopi
urutan nukleotida yang kita miliki atau
selain mengcopy urutan nukleotida kita
bisa memasukkan data kita dari format
fasta yang telah kita download di video
sebelumnya jadinya ada dua pilihan ya
sama seperti belas kemarin di beras
kemarin kita bisa memasukkan data dengan
mengcopy Urutan nukleotida atau
mengupload fasta pada saat multiple lain
menunaikan Cluster Omega ini kita juga
bisa melakukan dua opsi tersebut pertama
Mari kita coba dengan cara upload pasta
caranya bagaimana kita pilih di sini ada
tombol bros-bros kita klik klik kiri
sekali kemudian kita cari tau
Hai format pasta yang kita download
kemarin itu dimana Nah ini ya kebetulan
kau di laptop saya di folder download
dan namanya belum saya ubah yaitu sekdam
Saya klik kiri sekali kemudian open
Hai setelah ini nanti kita coba length
Langkah kedua ya kita copy langsung saja
Hai Papa format
Hai yang mana kita copy langsung urutan
nukleotida yang kita miliki Nah setelah
kita upload file fakta tersebut Langkah
kedua adalah menset parameternya di sini
ada bermacam-macam ya kita tetap
menggunakan kelas-kelas double you yang
pertama ini with character count
Hai kemudian di sini ada beberapa opsi
kita Diva kan aja tidak bisah kita
ubah-ubah kemudian di step ketiga kita
submit pekerjaan kita bila anda ingin
mendapatkan hasil melalui email ya ini
tinggal dicentang saja Kemudian masukkan
email kita dan subjek email yang kita
inginkan
Hai namun pada tutorial kali ini kita
tahu saya menggunakan email langsung
saja kita submit kita klik kiri sekali
tombol submit kemudian kita tunggu
sebentar prosesnya
Hai nadanya dikatakan hasil kita ini
akan tersimpan di database faskel Omega
selama tujuh hari setelah tujuh hari
Maka hasilnya akan otomatis dihapus
Hai dan ini nama ID dari job kita class
Lho kok strip 12021 dan sebagainya
Hai Nah Ini hasilnya sudah muncul ya
status
Hai bisa kita lihat
Hai ini hasil multiple lainnya
Hai basah pertama hingga basah ke-60
kemudian ini basah ke-61 ingga 120
bahasa 121 hingga 180 dan seterusnya
kita lihat tidak hanya dua squash yang
disejajarkan namun langsung berapa ini
3456 scenes bandingkan dengan hasil
glass kemarin alam lainnya hanya 22 eh
nih linen and wave ini squash pertama
ini scones kedua yang diajarkan
sedangkan yang ini langsung 66 nya
dijajarkan
Hai Neng Keke
Hai bisa kita lihat sampai bawah ya kita
Scroll down
nah ini hasilnya
Hai panjang sekali ya Bahasanya Oke
Selain hasil lain seperti ini Kita juga
bisa melihat
Hai pohon filogenetik nya Coba kita klik
menu pohon filogenetik
Hai nah ini hasilnya Nah kalau ini kado
G ya cladogram itu cabangnya tidak
memiliki makna kekerabatan genetiknya
tidak memiliki makna jarak genetiknya
Bila kita ingin mengatur cabang ini
sehingga cabang ini juga
mengilustrasikan jarak Jenet iq-nya maka
kita pilih branch link-nya dengan option
yang riil bukan cladogram Coba kita klik
nah hasilnya seperti ini jadinya panjang
dari cabang akan menggambarkan genetics
tensenya dari scene-scene yang kita
bandingkan ini
Oh gitu ya
Hai itu cara kita kalau kita menggunakan
pasta sekarang Mari kita coba tidak
menggunakan fakta-fakta
Hai langsung kita copy
Knuckle tidak kita caranya bagaimana
pertama kita kembali kita mengakses Pa
Omega kemudian selain membuka Clash of
Clash Royale Mega Mari kita buka lagi
hai hai
I make setelah kita buka ncbi eh
langsung kita pilih nuclear threats aja
ya biar nanti mudah mencari urutan
nukleotida nya kita pilih nukleoid
kemudian di Kolom pencarian misalkan
kita menggunakan gen yang lain ya
sitokrom b dioksidasi ini juga termasuk
protein yang ada di mitokondria yang
turut terlibat dalam fosforilasi
oksidatif juga respirasi seluler juga
saya Tuliskan disini situ room
MP3 mudian Saya klik search
Hai kemudian kita tunggu sebentar
hasilnya
Hai nah ini hasilnya ini ada berbagai
macam spesies pohon
Hai ada dari aku mimpiin Ussy Sumbi
glacialis emsland Dita Anggun hilang
kemudian akun lagi sekarang Mari kita
coba pilih 55 spesies
Hai misalkan yang pertama ini akun Mini
kemudian glasial is
Hai kemudian splindit
Hai kemudian misalkan yang lain ya
kebanyakan aku Meme ini m.now find a
nilai karena contoh ini ada tutorialnya
hanyalah contoh melakukan multiple lain
membaca ini saya memilih nya rendem ya
kuenya ya
hai oke sekarang bagaimana setelah kita
membuka jayne Bang dari setiap
nukleotida ini
Ayo kita kemudian ke menu pasta kita
klik vastaya
Hai semuanya kita klik savas
Hai yang kemudian kita tunggu prosesnya
agar diarahkan ke
Hai nah ini hasil fastmail
Hai sekarang semuanya ini kita copy dari
baris pertama dari baris identitas
hingga bahasa terakhir berbeda dengan
beras kemarin ya kalau balas Kemarin kan
kita mengcopynya dari bahasa pertama
hingga bahasa terakhir kalau multiple
lain menit kita copy dari identitas
sehingga bahasa terakhir ditekan
kemudian kontrol C kemudian kita kembali
kekelas kalau Mega di sini jangan lupa
diganti DNA terlebih dahulu kemudian
kita tidak upload file Namun kita
langsung memasukkan squash kita kita
klik kiri sekali didalam kota ini
kemudian kontrol V lalu enter kemudian
kita ke data kedua miliknya big rasialis
sama dicopy dari identitas sampai basah
terakhir kontrol C kembali ke kota sini
kemudian jangan di-enter jangan diberi
spasi langsung di kontrol
Hai kemudian enter lagi tanpa Enter Dua
kali aja jadinya enternya cukup sekali
sehingga tidak ada spasi kemudian kita
ke sekuensi yang ketiga dari MCB Andhika
kita copy lagi kontrol C kemudian
kontrol V enter sekali saja agar tidak
ada spasi kemudian kita copy yang ini m
Novin aiyyaa badannya air ya kita copy
semua rumus
kmudian kita kontrol V Oke hanya semua
nukleotida yang ingin kita alignment
sudah dimasukkan
Hai kemudian save keduanya kita tetap
menggunakan Castle double yoghurt
karakter count kemudian opsinya file
kemudian kita klik submit sehingga
proses multiple lemon berjalan
Hai dan perlu kita tunggu sebentar
Hai nah ini hasilnya
hai oke karena saya rendem ya mencarinya
ya jadinya hasilnya Ya ya seperti ini
tetapi dengan langkah seperti ini kita
tahu ya bagaimana caranya kita melakukan
multiple linen tanpa upload format fasta
namun langsung mengcopy squash yang kita
miliki begitu
hai oke oh ya ada yang belum saya
sampaikan di Tahapan pertama tadi
Sekarang kita coba baca Maksudnya apa
sih ini
hai oke ketika ada spreadnya seperti ini
artinya tidak ada bahasa di daerah sana
Hai kemudian ketika
Knuckle tidak nukleotida tersebut
memiliki bahasa yang sama misalkan di
sini ya kita melakukan multiple alamin
Lynn pada 4 nukleotida dan ternyata
dibahasa nomor sekian itu Bahasanya sama
semua maka akan diberi tanda bintang
misalkan ini ini bahasa ke-61 keempat
nukleotida ini memiliki bahasa yang sama
yaitu cccc sitosin semua sehingga di
sini diberi tanda bintang kemudian
bahasa yang selanjutnya Berbeda sehingga
tidak ada bintang karena Disini sitosin
yang nukleotida
Hai adenin kemudian yang ketiga sitosin
yang keempat ditetesin sedangkan
selanjutnya guanin semua sehingga ada
tanda cintanya begitu jadinya ketika
kita melakukan multiple linear kemudian
kita melihat atau kita mengetahui bahwa
semua bahasa Di posisi tersebut sama
maka di bagian paling bawah Dari hasil
multiple linear akan muncul anda pintar
namun ketika softlens yang kita libatkan
dalam multiple lemon pada daerah
tersebut tidak memiliki basah misalkan
ini ya
Hai maka tidak ada bahasa Inggris
Tuliskan namun disimbolkan dengan strip
ini artinya pada bahasa 1-60 tidak ada
bahasa pada rantai nukleotida dari x775
07 ini namun pada tiga rantai nukleotida
yang lain terdapat
Hai basa nitrogen gitu
hai oke demikian penjelasan saya terkait
Bagaimana caranya kita melakukan
multiple lain mendengar menggunakan
Cluster Omega pada video selanjutnya
kita akan mempelajari bagaimana caranya
menggunakan Mega software yang biasa
digunakan untuk melakukan analisis
filogenetik juga
Hai terima kasih atas perhatiannya Mohon
maaf bila ada kesalahan Assalamualaikum
warahmatullahi wabarakatuh
Resume
Read
file updated 2026-02-12 02:10:54 UTC
Categories
Manage