Transformasi, Transduksi, dan Konjugasi pada Bakteri
es7x4nD_E1w • 2021-05-09
Transcript preview
Open
Kind: captions Language: id Halo assalamualaikum warahmatullahi wabarakatuh di video Sebelumnya kita telah mempelajari peristiwa pindah silang yang merupakan contoh peristiwa rekombinasi yang dapat ditemukan di up riotic dan pada video kali ini Mari kita pelajari peristiwa transformasi transduksi dan konjugasi yang dapat memfasilitasi terjadinya peristiwa rekombinasi pada bakteri sekarang kita bahas transformasi terlebih dahulu secara sederhana kita dapat mengartikan transformasi sebagai peristiwa yang menyebabkan proses transfer DNA dan proses transfer dana ini melibatkan DNA asing dari lingkungan jadinya misalkan ada satu sel bakteri di suatu medium kemudian di medium itu ada potongan DNA asing laku lalu potongan DNA asing itu masuk ke dalam bakteri itulah yang namanya peristiwa transformasi sederhana seperti itu ya bakteri mengambil DNA asing dari lingkungannya Hai nah DNA asing tersebut biasanya ukurannya sangat kecil di sini dikatakan ukurannya itu hanya 0,2 hingga 0,5% dari keseluruhan kromosom sehingga patah umumnya segmen DNA tersebut potongan DNA tersebut hanya membawa satu gen saja dan Adakalanya hanya membawa dua gen ndak semakin dekat 2gen maka semakin sering atau semakin tinggi frekuensi ku transformasi keduanya ko transformasi itu peristiwa yang menyebabkan 2gen sama-sama ditransformasikan misalkan Gena sama begitu dekat maka gen a sama B itu semakin sering ditransformasikan secara bersamaan sehingga frekuensi kontra formasinya semakin tinggi bila dibandingkan dengan Gena dengan gen c misalkan karena genrenya lebih jauh begitu Hai sekarang kita lihat tahapan dari peristiwa transformasi nah ini misalkan ada bakteri ya kemudian ini kromosomnya bentuknya sirkuler ingat karena bakteri itu bentuknya kromosomnya sirkuler sedangkan materi genetik DNA di dalam inti sel eukariot itu bentuknya linear kemudian di sini ada DNA asing unting ganda kemudian tahapan selanjutnya adalah DNA asing ini akan menempel kesini reseptor khusus sini ya Nah seperti yang perlu saya seperti yang kita ketahui tidak semua bakteri itu dapat melakukan transformasi hanya bakteri-bakteri kompetensi saja yang bisa melakukan peristiwa transformasi bisa mengambil DNA asing dari lingkungan kalau bakterinya non competent maka dia tidak bisa mengambil DNA asing sehingga transformasi tidak dapat terjadi kembali lagi ke sini ya ini DNA asing kemudian DNA asing ini akan menempel di reseptor di sini Hai kemudian nah DNA asing itu akan didegradasi ini kan awalnya untung Ganda ini nanti akan masuk unting tunggal ke sitoplasma ya jadinya untung ganda didegradasi menjadi ujung tunggal ketika masuk kemudian untung tunggal itu masuk di sitoplasma dari bakteri tersebut kemudian denouncing tunggal itu nanti akan merefresh mengganti segmen DNA dari DNA kromosom bakteri tersebut jadinya dia ini nanti nempel ke sini setelah nempel salah satu unting ini akan diganti diri please hasilnya seperti ini Oh ya ini awalnya warnanya kan orangnya sehingga disini diganti menjadi biru kemudian segmen DNA awal yang warna orangnya mana dia lepas disini nah kemudian segmen DNA dari sini tadi yang lepas ini kemudian didegradasi dihancurkan Hai sehingga bakteri ini memiliki kromosom Metro dupleks disini dia punya kromosomnya sendiri kemudian disegmen ini ada miliknya dirinya sendiri dan mil dari DNA asing itu tadi sehingga nanti ketika pembelahan sel ada sel yang membawa kromosom yang asli dari dirinya ada juga sel anakan yang membawa kromosom dari den asing tadi lho kok bisa karena nikah nanti digandakan dan ingat peristiwa replikasi itu satu unting menjadi satu template untuk melekul baru Nah karate sini bagian sini ada tersusun atas dua unting yang berbeda satunya miliknya dirinya sendiri satunya miliknya DNA asing makan nanti satu molekul baru itu sama-sama membawa milik dirinya sedangkan satu molekul yang lain membawa dari DNA asing tadi sehingga satu progeny satuan akan Hai dna-nya sama dengan induknya satuan akan dna-nya membawa DNA asing tadi ini secara umum peristiwa transformasi terjadi sekarang kita lihat fertil beberapa fase atau berapa tahapan transformasi yang penting seperti yang dikatakan tadi ya transformasi itu melibatkan DNA asing di lingkungan kemudian dia akan masuk ke bakteri competent melalui reseptor khusus nah ini ya Nah reseptor khusus ini kalau kita detail kan strukturnya seperti ini ada comgame ada komeaa kemudian di sini ada diantara dinding sel dan membran sel ini ada deoksiribonuklease yang fungsinya mendegradasi unik ganda menjadi ujung tunggal sehingga di sini kita lihat awalnya untuk ganda kemudian dipotong-potong sehingga disini menjadi hunting tunggal setelah unit tunggal masuk ini akan ditempeli oleh single strand dinding protein Muncul lagi protein Iya nah fungsinya menempel di sini sehingga tidak kok hairpin Hai kemudian dia juga akan ketempelan protein mereka juga yang fungsinya memigrasikan DNA untai tunggal begitu kemudian di sini ada comfaa juga yang fungsinya adalah mentranslokasikan DNA tunggal ini Hai Nah setelah dia untuk tunggalnya masuk dia akan berada di sitoplasma ini disimbolkan Amin mohon maaf aplus ya ya jadinya disini tidak digambarkan tahapan ini nah kemudian upload itu langsung bergabung disini menggantikan salah satu unting milik bakteri kromosom bakteri tersebut sehingga disini lepas Amin satu Amin satunya masih tetap di sini sedangkan aplus yaitu DNA asing ini tadi sekarang sudah berada di sini mereplace mengganti Amin ini nah ini nanti kemudian didegradasi Hai peristiwa rekombinasi nya terjadi di mana ya terjadi di sini jadinya kalau DNA asing hanya masuk ke sitoplasma itu belum terjadi rekombinasi tetapi transformasi berlangsung rekombinasi baru dikatakan terjadi ketika Apple sini sudah bergabung dengan Amin disini kenapa Karena disini sudah terjadi penggabungan dua molekul DNA yang merupakan definisi dari peristiwa rekombinasi Sekarang mari kita bahas transduksi nah secara sederhana transaksi itu dikatakan sebagai proses transfer DNA yang melibatkan virus jadinya virusnya sebagai Factor yang memediasi peristiwa transfer DNA nah transduksi ini dapat dibagi menjadi dua yaitu transduksi umum dan transduksi khusus dikatakan transduksi umum bila virus tersebut dapat mengambil bagian segmen DNA secara bebas jadinya apapun segmen DNA nya bisa oleh virus tersebut dari satu bakteri ke bakteri lainnya sedangkan transduksi khusus bila melibatkan virus yang hanya membawa gen-gen tertentu saja sehingga dikatakan khusus kemudian sama seperti transformasi semakin dekat kedua gen maka semakin tinggi frekuensi cool transaksi diantara keduanya ngekek sekarang kita lihat Hai bagaimana keterlibatan virus dalam peristiwa transfer DNA pada bakteri nah disini contohnya virus the first in ya Nah virus ini kita lihat Hai ini virus ini tuh bisa menginfeksi bakteri dia punya DNA DNA nya bisa diinjeksikan ke bakteri tersebut karena virus ini menginfeksi bakteri maka virus ini dikatakan sebagai bakteriofage segitu Kan virus virus yang menginfeksi bakteri bakteri Rofiq Nah sekarang kita lihat Ketika suatu sel itu diinfeksi oleh virus seperti yang pernah kita pelajari di microbiology atau di SMA babak teri ataupun virus kita mengenal ada siklus litik dan lisogenik sekarang kita singgung lagi misalkan ini adalah virus materi genetiknya secara mu biar cedera biar mudah kita anggap berwarna pink atau merah ya kemudian disini ada bakteri nah kromosom bakterinya berwarna biru Hai kemudian virus ini menginfeksi bakteri tersebut kemudian dna-nya diinjeksikan sehingga masuk ke sitoplasma nah ini namanya DNA fiqh DNA miliknya virus tadi Nah kemudian ketika DNA virus tersebut bergabung misalkan di sini ya jadinya ini ini DNA ini kemudian bergabung ke sini maka ini akan masuk fase lisogenik Hai jadinya ini DNA sitoplasma kemudian DNA sitoplasmanya akan bergabung dengan DNA milik kromosom utama dari bakteri tersebut nah ketika terjadi integrasi antara DNA fage dengan DNA milik bakteri maka dikatakan terbentuk profig profec itu DNA fiqh yang telah terintegrasi dengan DNA kromosom milik bakteri Hai nah pada fase lisogenik bakteri tidak akan lisis tidak akan pecah namun dia akan selalu membawa proyek tersebut akan tersisipi oleh DNA asing tersebut sehingga nanti ketika dia memperbanyak diri ya sudah setiap anakannya ini membelah sel y22 biner ya pembelahan biner setiap pembelahan selalu kromosomnya membawa sisipan denah dari virus tersebut Hai beda dengan file siklus litik nah Pada siklus litik Dena milik Civic tadi tidak bergabung tidak terintegrasi dengan kromosom milik bakteri namun dia akan membentuk kromosom mohon maaf membentuk virus-virus baru seperti ini ya jadinya DNA ini akan melakukan transkripsi dan translasi sehingga menghasilkan protein protein protein protein yang berfungsi membungkus DNA miliknya nah kemudian ini virusnya akan banyak sehingga nanti virus ini akan keluar dari sel tersebut akan pecah selnya lisis Hai nah fase lisogenik ini siklus lisogenik Ini bisa juga tiba-tiba masuk kelitik ketika terjadi induksi misalkan ada radiasi dan sebagainya nah ini gambarnya ya ketika terjadi induksi makan nanti dia akan masuk klitik ketika terjadi induksi yang awalnya DNA virus ini nyicip di kromosomnya bakteri DNA virus ini akan lepas setelah lepas dia akan ditranskripsi translasikan menghasilkan banyak virus kemudian virus tersebut akan melisiskan bakteri tadi Hai atau nanti virus tersebut secara bergantian akan keluar dari bakteri tersebut melalui banding misalkan itu dan peristiwa induksi yang menyebabkan perubahan dari lisogenik litik itu jarang terjadi misalkan diinduksi Yufi atau sinar-x nah Seperti yang saya singgung tadi transduksi itu kan secara umum dibagi menjadi dua tranduksi umum dan transaksi khusus tranduksi umum itu bila virus dapat membawa segmen DNA atau gen secara acak tidak harus tertentu nyanyi contoh mekanisme dari transaksi umum tadi jadinya semacam fase litik tadi ya awalnya ada virus menginjeksikan dna-nya nah kemudian DNA yang ada di sini akan menginduksi Hai itu apa-apa pendegradasian materi genetik milik bakteri Tadi kenapa kok materi genetiknya dipecah atau didegradasi agar bisa menjadi bahan dasar bagai virus tersebut untuk mereplikasi dna-nya nakal Anda virusnya ya ininya virusnya memasukkan DNA ke dalam bakteri tadi kemudian DNA milik bakteri tadi dipecah-pecah sehingga potongan DNA tersebut bisa digunakan sebagai bahan dasar membentuk DNA baru merek virus tersebut kemudian terjadilah peristiwa transkripsi translasi bentuklah partikel-partikel protein yang nanti akan membungkus DNA milik virus tadi sehingga nanti muncul virus-virus baru kemudian virus baru tersebut akan keluar melalui peristiwa banding atau pertunasan atau virus tersebut juga bisa pecah eh Mohabbatein tersebut juga bisa pecah bisa lisis disini karena DNA milik bakterinya sudah dipecah-pecah Hai maka virus-virus baru ini bisa saja membawa DNA yang dipecah-pecah tadi sehingga nanti ada virus yang membawa segmen a-dha ribacter yg ada virus yang membawa segmen B ada virus yang membawa segmen C jadinya virus-virus ini membawa potongan DNA dari bakteri tadi kemudian dia akan menginfeksi bakteri lainnya karena dia tadi sudah membawa potongan DNA dari bacteria bakteri donor maka bakteri reception tadi akan menerima segmen DNA adari bakteri donor tadi ya bakteri reception akan memerima segmen DNA dari bebagai donor tadi begitu ada bakteri residen lain menerima segmen DNA yang lain karena virusnya yang menginfeksi adalah virus yang lain yang membawa segmen bagian lainnya juga dan kemudian Hai selama the sea apa ya selama sih virus ini DNA virus ini tidak bergabung ke Hai ke kromosom dari bakteri rekombinasi tidak terjadi jadinya ini memang peristiwa transduksi Namun karena peristiwa ini tidak melibatkan penggabungan DNA antara virus dengan bakteri maka rekombinasi tidak dikatakan terjadi namun kalau seperti ini ya teruji terbentuk profix seperti ini maka rekombinasi terjadi kenapa karena terjadi penggabungan antara miliknya virus dengan bakteri nyanyi gambaran transaksi umumya Nah sekarang kok transduksi khusus itu bagaimana nah transaksi khusus itu terjadi ketika terjadi di Hai kesalahan-kesalahan apa Nah ini kita pelajari I am misalkan tadi saya jelaskan di awal Hai kalau masuk siklus lisogenik maka seks DNA milik virus akan menyisip ke DNA bakteri sehingga membentuk profig gambarannya misalkan seperti ini ini DNA virus misalkan virus lamda ini kromosom milik bakteri ecoli nah ini awalnya seperti ini kemudian ini bisa bergabung Kenapa bisa bergabung karena kedua DNA ini memiliki bagian daerah yang homolog sih kromosom virus punya ADB si kromosom bakteri punya ADB kedua daerah ini homolog kemudian ini bisa terjadi rekombinasi Ini dipotong disini dipotong kemudian ini bergabung bergabung seperti ini Hai kemudian Adik hasilnya seperti ini begitu ini kalau kita baca kearah atas nah sekarang kita baca kearah bawah jadinya nih peristiwa integrasi nya kalau peristiwa integrasi awalnya ada kromosom mirip virus kemudian ada kromosom milik bakteri kemudian daerah yang homolog berpasangan kemudian nanti terintegrasi seperti ini mengakibatkan Hai nah kemudian suatu saat Hai bisa terjadi eksisi ex-situ pelepasan Hai DNA virus yang sudah terintegrasi dengan DNA bakteri tadi Nah peristiwanya tinggal kita balik saja ini awalnya proyek ya DNA milik virus tergabung di sini kemudian dia akan kembali perekomendasi semacam ini ya attp ini nanti akan berpasangan dengan daerah sini kemudian ADB yang sini berpasangan dengan disini akibatnya apa ujung orangnya ini akan berpasangan dengan ujung orangnya ini ujungbiru yang ini berpasangan dengan ujungbiru ini akibatnya orangnya lepas nah ini peristiwa eksisi nah secara normal peristiwa integrasi dan ex-situ terjadi pada titik yang sama sehingga Awalnya si virus itu memiliki segmen JF hingga apa ini cm maka ketika lepas dia tidak mengalami perubahan segmen namun Adakalanya peristiwa eksis itu tidak tepat nah ini gambarannya Hai nah ini tidak pasti nih rekombinasi nya tidak pas sebetulnya kan rekomendasinya disini dia TTP sama http ternyata rekombinasi nya terjadi di sini Hai akibatnya apa Nah ini nanti hasilnya seperti ini segmen biru ini akan terbawa oleh sirkuler orangnya ini dan daerah warna orangnya ini ketinggalan di sini Mi ketinggalan di kromosom bakteri akibatnya apa Nah kromosom sirkuler kecil ini nanti ini akan dibawa oleh virus nah virus ini nanti akan menginfeksi bakteri lainnya akibatnya segmen gen kali ini akan dibawa oleh virus dari bakteri donor ini ke bakteri resipien ke bakteri yang lain inilah contoh mekanisme transaksi khusus Oh begitu Hai Nah sekarang peristiwa selanjutnya yaitu konjugasi secara sederhana gue juga sih adalah proses transfer DNA melalui kontak langsung jadinya kedua bakteri-bakteri donor dan bakteri residen melakukan kontak langsung sehingga transfer DNA dapat terjadi Hai dan sama seperti transformasi transduksi konjugasi ini bisa kita gunakan untuk memetakan urutan DNA kalau pada transformasi transduksi kan prinsipnya semakin tinggi frekuensi ku transformasi ataupun transduksi maka dapat dikatakan gen tersebut keduanya semakin dekat Nah kalau pada konjugasi prinsipnya agak beda menggunakan permainan waktu nanti akan kita singgung sejenak kalau kita belajar konjugasi kita akan mengenal tiga macam bakteri-bakteri fmn flash dan hfr nah seperti yang pernah kita pelajari di Sumba plasmidnya suatu bakteri itu dapat melakukan peristiwa konjugasi gila Dia memiliki faktor ff.icu fertility Hai nah batteries Mini tidak bisa melakukan rekomendasi tidak bisa melakukan konjugasi sedangkan bakteri F + dan hfr bisa kenapa Karena Dia memiliki faktor F Nah sekarang kita lihat jadinya bakteri fb-an itu bakteri yang tidak memiliki faktor F bakteri Everest adalah bakteri yang memiliki faktor F namun faktor f-net autonom Hai terlepas dari kromosom utama sedangkan hfr adalah bakteri yang memiliki faktor F yang faktor efeknya terintegrasi dengan kromosom milik bakteri I have sendiri merupakan singkatan dari Hai frekuensi rekombinan bakteri dengan frekuensi rekombinasi yang tinggi Hai Oke Baik flash maupun hfr ini bisa melakukan konjugasi ketika F + konjugasi dengan Eminem akeh men akan berubah menjadi F belas begitu juga hfr ketika FR konjugasi dengan F Min fb-nya akan berubah menjadi F + 1H Hai Nah sekarang kita lihat ternyata faktor F ini bisa lepas bisa bergabung nah sama seperti peristiwa terbentuknya profig pada transduksi tadi secara sederhana bentuknya seperti ini nah ini peristiwa integrasi ya ini ada faktor F kemudian ini kromosom utama bakteri kemudian sama seperti transduksi late sebelum terjadi penggabungan maka dua daerah dari kedua kromosom ini yang daerahnya homolog itu harus berpasangan semacam ini kemudian terjadi rekombinasi ujung sini akan bergabung disini ujung sini akan bergabung di sini ya Hai De akan bergabung dengan file akan bergabung dengan THR sehingga terbentuk seperti ini sehingga terbentuklah hfr nanti ini juga bisa lepas lagi melalui peristiwa semacam ini tadi di bentuk lingkaran seperti nah seperti ini dilipat seperti ini tekan hai oke Hai Nah sekarang kita lihat bagaimana peristiwa konjugasi yang melibatkan Everest dan F Min dikatakan Everest karena dia tidak tergabungnya faktor efeknya dengan kromosom utama ini donor ini bakteri resipien seperti yang saya katakan tadi konjugasi adalah peristiwa transfer DNA yang melibatkan kontak langsung antara bakteri donor dengan bakteri resipien nah ini ada kontak ini dan yang memfasilitasi peristiwa konjugasi adalah pilus pilih ya Pilih jamanya virus galau Hai nafil ini menyebabkan donor dan resipien bisa berinteraksi kemudian setelah berinteraksi disini terbentuk tabung konjugasi nah tabung konjugasi ini sebagai jalan untuk memasukkan atau mentransfer DNA dari donor kreasi been Nah kita lihat ya plastik faktor FPB tidak berpindah namun faktor F ini dicopy digandakan nah kopiannya ini akan masuk ke crazy friend sehingga donornya tetap Everest resipien nya fb-nya berubah menjadi Everest begitu Hai Nah sekarang kita lihat kalau melibatkan ini dikatakan hfr karena dia faktor esnya sudah tergabung terintegrasi dengan Hai kromosom utama sama konjugasi melibatkan feel atau virus kemudian setelah Hai berpasangan seperti ini terbentuk tabung konjugasi lagi-lagi ini dicopy lagi replikasi nama replikasinya rolling circular replication nah ini kemudian kita lihat ya Nah Ternyata menarik disini adalah Hai Hakim ya Ternyata menarik hai ketika and terjadi konjugasi Hai ini kita lihat ya DNA milik virus itu kan warnanya orangnya ketika terjadi konjugasi peristiwa transfer DNA itu dimulai disini kemudian akan berlanjut ke arah atas sini kemudian ke arah sini jadinya faktor fb-nya memohon makhluk milik virus ya yang warna ungu ini miliknya vektor F nah faktor Evi nanti akan dipotong-potong Hai dan ternyata ketika terjadi peristiwa konjugasi konjugasi itu diawali oleh sebagian faktor F dan diakhiri oleh sebagian faktor F lainnya jadinya faktor F ini dipotong-potong Oh ya jadinya nih titik ini sebagai titik awal konjugasi kemudian masuk kesini the set masuk ini melalui peristiwa replikasi juga sehingga nanti bakteri recipe and akan memperoleh Hai DNA DNA dari bakteri donor dan peristiwa ini membutuhkan kondisi yang stabil seringkali peristiwa ini tidak sempurna jadinya hanya sebagian game saja yang masuk jadinya misalkan pada menit ke-10 terjadi goncangan maka misalkan hanya ini saja 3gen awal ini yang masuk Hai kalau menit nol sudah terjadi guncangan tidak ada gen yang masuk kalau puncaknya goncangannya menit 18 maka Ken yang masuk ada Oh begitu jadinya semakin lama kondisi stabil lingkungan dijaga maka semakin banyak gen yang ditransfer Hai nah prinsip ini bisa menjadi dasar kita memetakan urutan gen dari bakteri dengan menggunakan waktu adanya misalkan kita punya banyak bakteri kemudian kita konjugasikan kemudian di menit ke-5 kita guncang sehingga konjugasi terpisah konjugasi gagal kemudian kita cek beberapa gen yang sudah ditransfer kangenn apa saja yang berhasil ditransferkan kemudian kita lakukan konjugasi lagi Kemudian menit ke-10 kita guncang kita cek genman yang sudah berhasil dikonjugasikan Nanti bisa kita catat misalkan ini ini menitnya menit pengguncangan nya menit ke 10 20 30 40 kemudian ini frekuensinya Oh Ternyata di menit ke-10 itu gen ini sudah selalu ditransfer jadinya frekuensi konjugasinya 100% Hai Kemudian pada Ken la kene pada menit ke puluh Belum belum dikonjugasikan dia mulai dikonjugasikan Di menit ke-18 dan akan semakin meningkat hingga 40% pada menit 60 dan seterusnya nah urutan ini bisa kita Tuliskan kemudian urutan frekuensi ini menjadi indikasi urutan gen sehingga urutan gennya adalah seperti ini Regita itu cara memetakan gen dengan melibatkan peristiwa konjugasi demikian penjelasan saya terkait transformasi transduksi dan konjugasi yang dapat menyebabkan peristiwa rekombinasi pada bakteri terima kasih atas perhatiannya Mohon maaf bila ada kesalahan Assalamualaikum warahmatullahi wabarakatuh
Resume
Categories