Kind: captions
Language: id
Halo assalamualaikum warahmatullahi
wabarokatuh berjumpa lagi dengan saya di
channel YouTube saya ensiklopedia Ahmad
Fauzi channel yang menjelaskan berbagai
hal yang berkaitan dengan penelitian
publikasi ilmiah analisis data dan
berbagai pengetahuan lain yang mungkin
dapat meningkatkan pengetahuan ataupun
keterampilan kalian di video Sebelumnya
kita telah mempelajari Apa itu virtual
skrining dan bagaimana tahapan melakukan
virtual sini pada video kali ini Mari
kita tekan kan pembahasan kita terkait
metode
Fifo stocking merupakan salah satu
metode dalam Informatika yang tujuannya
dapat digunakan untuk mengidentifikasi
potensi senyawa alami sebagai kandidat
obat lalu apa itu rezeki secara
sederhana info stocking merupakan usaha
untuk mencari target protein yang dapat
berikatan dengan ligan tertentu atau
senyawa alami tertentu jadinya kebalikan
dengan virtual skrining di video
sebelumnya Kalau virtual trading di
video sebelumnya kita punya banyak
senyawa alami misalkan punya 1000 data
senyawa alami kemudian kita cari
dari 1000 senyawa alami tersebut Manakah
senyawa alami yang mampu menjadi ligan
dari suatu protein sedangkan medali
masukin kebalikannya senyawa alamiah
cuma satu atau beberapa kemudian kita
cari Protein mana yang dapat diikat oleh
senyawa Lini tersebut apa protein dapat
berikatan dengan senyawa alami tadi
jadi kalau kita punya banyak nyawa
kemudian kita pilih senyawa alami yang
dapat nempel di protein sedangkan kita
punya satu atau beberapa senyawa alami
kemudian kita cari dari banyak protein
target dari banyak protein
manakah protein yang dapat ditempeli
oleh senyawa alami tersebut nah ini
gambaran skematis tangga
Nyalakan ini dragnya kandidatnya Eh ya
ini misalkan senyawa alami kemudian ini
protein-protein ya nah kemudian kita
cari senyawa alami tersebut dapat
menempel dengan bagus di protein yang
mana sih
kemudian nanti kita kita Urutkan
protein-protein mana yang mampu
berikatan dengan kandidat obat tadi
dengan senyawa alami tadi manakah yang
terbaik kebalikan dari
bagaimana tahapan-tahapan pertama
tentunya kita yang perlu menyiapkan
struktur tiga dimensi dari ligan atau
senyawa alami yang kita pilih tadi
misalkan kita memiliki suatu senyawa
alam kita ingin kita beri interest kita
tertarik dengan satu senyawa alami
tertentu senyawa alami ini dapat nempel
di Protein mana sih gitu ya Nah tahapan
pertamanya kita cari terlebih dahulu
data struktur tiga dimensi dari senyawa
alami tersebut dari ligan tersebut Nah
untuk chrysler tiga dimensi dari senyawa
alami tersebut kita bisa menggunakan
database Pak Kapten
kemudian tahapan selanjutnya adalah kita
memprediksi potensi dan efek samping
dari senyawa alami yang kita dapat tadi
misalkan dari satu senyawa alami sudah
kita peroleh struktur Tiga dimensinya
sekarang kita prediksi potensinya
sebagai obat dan efek sampingnya ia
dijadikan
caranya bagaimana kita bisa menggunakan
website website online dengan
menggunakan website ini nanti struktur
dari senyawa alami tersebut bisa
dimasukkan di pas online kemudian nanti
diidentifikasi Oh dia berpotensi sebagai
obat atau malah dia menghasilkan efek
samping yang berbahaya
kemudian setelah kita prediksi potensi
dan efek sampingnya kemudian kita
mengumpulkan
kandidat proteinnya protein targetnya
kita kumpulkan senyawa alami kita punya
satu Misalkan kemudian kita kumpulkan
banyak Pro Gin target
misalkan ada beberapa protein target
misalnya mungkin 100 gitu ya misalkan ya
Nah struktur struktur protein target
tersebut bisa kita peroleh dari database
lain yaitu PDB protein tetapi disini
bisa kita mengumpulkan
banyak-banyak struktur protein yang kita
anggap sebagai kandidat target dari
senyawa alami tadi selanjutnya kita
tentukan by ding set dari
protein-protein kandidat tersebut nah
salah satu cara untuk menentukan by
mindset adalah kita bisa mengakses ini
kemudian kita masukkan protein tersebut
beautiful kemudian kita baca referensi
nya yang muncul di Jennifer tersebut
kita cari gimana sih daerah by YD dari
protein kandidat-kandidat tersebut
kemudian baru kita lakukan docking
nah ini Ya dengan berbagai
Hai software ya salah satu software yang
bisa kita gunakan adalah ini lirik ya
dengan menggunakan software ini kita
bisa melakukan blocking di video
Sebelumnya saya sudah menyinggung
docking itu merupakan metode untuk
memprediksi interaksi antara senyawa
alami atau ligan dengan protein
targetnya proyektornya nanti akan muncul
score nanti skor yang terbaik akan kita
pilih setelah kita pilih skor terbaik
kita pilih protein target yang mampu
berikatan dengan senyawa alami yang
terbaik tadi
setelah kita pilih protein target dan
protein target yang skornya paling bagus
dari doping kemudian nanti kita lakukan
assessment kualitas dan kandidat obat
Misalkan ya misalkan
misalkan kita menggunakan senyawa
alamiah senyawa alamiah itu kemudian
kita prediksi potensinya Apakah dia bisa
menjadi kandidat obat menggunakan
pasonline kemudian kita aja kerjamu dari
senyawa tersebut Oh ternyata senyawa ini
berpotensi dan tidak memiliki efek
samping yang berbahaya begitu kemudian
senyawa kita simpan dahulu kemudian kita
cari protein-protein yang bisa diikat
oleh senyawa atau misalkan protein-1
protein 2 sampai begini ada protein
12345 kemudian proses Spain 12345 kita
cari bytenya
satu peningset daerah mana protein
kemudian kita docking menggunakan ini
software ini kita
senyawa-senyawa adanya senyawa-senyawa
protein-protein mana yang skornya paling
bagus ketika didoping dengan senyawa
protein misalkan yang paling bagus
berikatan dengan ligan senyawa ada di
maka kita lanjut Oh ternyata si senyawa
itu dapat berikatan bagus
skornya bagus dengan protein 3 nanti
kita lihat profil tiga ini terlibat
dalam metabolisme
protein ini terlibat dalam penyakit mana
sih sehingga bisa kita simpulkan
sehingga
apa namanya ada di senyawa akan di
dapat berpotensi sebagai obat penyakit
tertentu begitu namun sebelum kita
menyelesaikan Rivaldo King ini kita akan
terakhir kita juga perlu Melakukan
asesmen kualitas
hadiah senyawa kemudian kita assessment
kualitas Apakah dia secara komputasi
bisa menjadi topik misalkan kemudian
secara komputasi dia Bagaimana absorpsi
distribusi
kemudian metabolisme ekskresinya
akhirnya ya begitu nah kemudian kita
juga lihat Kita uji drag lightness nya
drag mesin itu kemiripan obat Hai Nah
kita bisa menggunakan meeting schedule
Apa itu Irul akan kita bahas nanti
begitu Nah setelah itu baru nanti bisa
kita laporkan hasilnya sehingga kalau
kita rangkum dia seperti ini kalau
doping yang kita pelajari di video
sebelumnya kita punya protein target
sudah kita butuhkan misalkan satu copy
target sedangkan kita punya banyak
senyawa alami nah kemudian
senyawa-senyawa alami bahkan 1000
senyawa alami kita cari Manakah senyawa
alami yang berperan menjadi Liga terbaik
terhadap protein target tersebut
Sedangkan pada River syuting sebaliknya
kita cuma punya satu ligan kita punya
hanya punya satu senyawa alami kemudian
protein targetnya ada banyak kemudian
kita cari senyawa alami ini dapat
berikatan dengan protein target mana sih
berikan yang terbaik pada yang mana sih
caranya gimana kita kemudian kita
kemudian kita pilih protein target Hai
yang skornya paling bagus ketika
didoping dengan senyawa alami tersebut
begitu lalu apa manfaat dari rezeki yang
pertama kita bisa mengidentifikasi
potensi tanaman tertentu sebagai
kandidat obat
misalkan kita ada Toga atau jamu-jamu
itu bahannya apa sih tanamannya Nah kita
lihat jamu itu ternyata ada senyawa
alami
senyawa alami X ini kita lihat
potensinya menggunakan Apakah benar Jabo
tuh bisa mengobati penyakit tertentu
maka kita lihat Uh jamunya senyawa X
jika kita kaji potensinya Apakah senyawa
X ini mampu berikatan dengan protein
yang terlibat dalam penyakit tertentu
Radit kemudian kita juga bisa dengan
River stocking memperkuat analisis
setelah mengkaji senyawa kandidat obat
yang sebelumnya telah digaji di
laboratorium jadinya misalkan sudah kita
sudah melakukan penganut pengkajian
suatu senyawa
bagus untuk
SS shoesbagoes sebagai
editor atau ligan terhadap protein
tertentu nah kemudian perlu kita perlu
kita pastikan secara Informatika
menggunakan Rivers
sebagai konfirmasi istilahnya seperti
itu
demikian penjelasan saya terima kasih
selanjutnya akan kita pelajari Bagaimana
caranya melakukan rezeki Jadinya
bagaimana caranya menggunakan Pyrex lama
ke untuk melakukan blocking Bagaimana
visualisasi hasil toping menggunakan
timal misalkan dan sebagainya Bagaimana
caranya mencari senyawa alami di
berbagai data bisa di begitu Oke terima
kasih assalamualaikum warahmatullahi
wabarakatuh