Kind: captions
Language: id
Assalamualaikum warahmatullahi
wabarokatuh berjumpa lagi dengan saya di
channel YouTube saya ensiklopedia Ahmad
Fauzi di video Sebelumnya kita telah
mempelajari bagaimana caranya
mendapatkan struktur tiga dimensi maupun
karena dikau snails dari senyawa alami
yang ingin kita analisis di video
tersebut kita juga telah mempelajari
bagaimana caranya menganalisis potensi
senyawa alam yang kita miliki Apakah
benar senyawa alami tersebut berpotensi
sebagai kandidat obat penyakit tertentu
atau tidak Dan pada video kali ini Mari
kita lanjutkan analisisnya di video kali
ini Mari kita pelajari Bagaimana caranya
mengidentifikasi protein-protein yang
bisa menjadi target senyawa alami yang
telah kita peroleh di video sebelumnya
oke langsung saja kita mulai kita ke
Google terlebih dahulu kemudian untuk
mencari atau menentukan protein target
dari senyawa alam yang kita miliki kita
perlu ke beberapa website
webserver pertama adalah AMP m
tulisannya seperti ini ya kemudian
disini ada apa m dari
www.inikata.com
menuju ke website kami perih Bagaimana
cara menggunakan web ini di bagian atas
sini ada menutup jok ini kita klik kiri
sekali kemudian kita upload struktur
dari senyawa alami kita di video
sebelumnya kita memilih kurkumin sebagai
senyawa alam kemudian di sini ada
beberapa format file yang bisa digunakan
lainnya sdf sesuai dengan format file
kurkumin yang kita untuk kemarin
sehingga disini kita bisa langsung klik
browse kemudian kita cari file yang
telah kita download sebelumnya ini
kurkumin.pdf
klik dua kali sehingga masuk ke sini
atau bros kemudian kita pilih filenya
kemudian kita klik Open ya jadinya bisa
Klik dua kali atau menggunakan menu open
tombol Open kemudian email address ini
perlu kita isi menggunakan email kita
masing-masing kemudian job description
bisa kita beri nama atau bisa kasih
deskripsi tapi ini opsional bisa diisi
bisa tidak kemudian di sini ada tombol
continue kita klik kiri sekali
kemudian di sini ada isian default saja
tidak usah kita ubah lalu kita klik
sakit
lalu kita tunggu prosesnya nah ketika
memprediksi protein target menggunakan
Paper ini waktunya membutuhkan waktu
yang agak lama
dan nanti akan muncul ide dari jok kita
id.job kita ini perlu kita save karena
Ide ini bisa kita gunakan untuk mengecek
Bagaimana progres dari job yang telah
kita submit gitu
nah ini ini id.job Hai dari
nah ini ya ini id.job kita ini harus
kita copy kemudian kita salin misalkan
ke notpetya
seperti ini kemudian kita senopatine
Nah ini bisa kita gunakan untuk mengecek
status jokita caranya gimana
ini bisa kita klik kiri kemudian kita
salin id.job kita disini kemudian kita
cek
Maka akan muncul seperti ini statusnya
masih dalam antrian job kita ini tadi
kemudian nanti
kalau kita udah selesai nanti kita akan
di kirim email dari Paypal saya beri
contohnya ya contoh dari email pamer
ngomong-ngomong
Hai nah ini
year Pamer job-id nih es harus finish
ini Contohnya bagaimana caranya kita
melihat hasilnya nah ini kita perlu
salin kemudian di sini ada get Resort di
website pamer ada menu Beatrice ini
perlu kita tiriskan kemudian coba ide
dari
id.job cita-cita vs di sini kita Salin
di sini lalu kita klik
Maka akan muncul list protein target
dari kurkumin
GTA caranya ya oke kemudian selain pamer
kita perlu menggunakan observer yang
lain
misalkan Swiss target Swiss target
prediction ini ya kemudian kita klik
alamatnya sesuai target prediction.com
kemudian tampilan websitenya seperti ini
spesiesnya kita pilih homo sapiens
kemudian Disini Mbak sdf tapi pakai
Smash maka kita bisa menggunakan Smash
yang kita dapat dari video sebelumnya
yang manis manisnya kurkumin kita saling
disini
kemudian secara otomatis di sisi kanan
akan muncul struktur dua dimensi dari
senyawa alami kita tadi lalu kita klik
pedic target ini proses ya memang
membutuhkan waktu juga ini tetapi tidak
selama pamer-pamer bisa berjam-jam
sedangkan si star gate ini hanya
beberapa detik ini progresnya Ini
hasilnya ya
oke kemudian ini bisa kita lihat
berbagai protein yang bisa menjadi
target dari kurkumin yang struktur dua
dimensi nya juga muncul di sini
selain pamer dan Sista get kita juga
perlu mengakses website for yang ketiga
yaitu super track
dari diprediksi charite detik ini
pikir sekali
hai lalu setelah website tersebut
terbuka kita pilih menu target
prediction ini kita klik kiri sekali
kemudian akan muncul tampilan seperti
ini Nah di sini kita bisa tulis nama
senyawa kita langsung di sini ya
misalkan kurkumin atau langsung kita
saling smiles yang kita miliki tadi
sms-nya si kurkumin yang dapat dari
paket ini bisa kita kontrol C kemudian
kontrol atau saling disini kemudian Klik
tombol search
Maka nanti akan muncul struktur dua
dimensi dari senyawa alami tersebut
kemudian baru kita klik start
calculation sehingga dia akan
mengkalkulasi atau memprediksi
protein-protein target dari kurkumin nah
ini hasilnya Oke
kemudian hasil ini perlu kita Swift ya
kita kalau kVA meper kearah bawah di
sini ada Rifat downloading ini bisa kita
klik sehingga terdownload dalam bentuk
csv kemudian di Swiss target ini
di sini ada export Resort kita pilih
yang Excel
kita klik
kemudian di Supertrap Nah di sini ada
siswi ini ada berbagai macam ya tabelnya
kita pilih yang ini nonton strong
binders jadi yang paling kuat ya ini
kita pilih yang XL kita klik juga
sehingga tertunduk ini bisa kita buka
file-file ini akan proteinnya banyak
setelah kita mendapatkan list protein
ini kita perlu melihat bagaimana
Interaksi protein-protein target dari
senyawa alami Nah untuk mendapatkan
gambaran interaksi berbagai protein ini
kita perlu mengakses web server yang
keempat yaitu istri BB free dc DB
seperti ini ya kemudian kita klik
ini
merupakan tampilan dari Ini Dedek Oke
kita cek lagi Excel dari nah ini xl-nya
enable editing diklik kemudian kita buka
Excel yang lain
Ini yang dari Swiss target
enable editing juga ini this
protein-protein target ya nah kemudian
kita kembali lagi ke string Dede di sini
ada berbagai pilihan kita pilih yang
multiple proteins
kemudian tulis-tulis protein target Ati
kita salin kesini ingat di sini adalah
keterangan one per Line jadinya satu
protein satu baris ya karena kita sudah
mendownload xl-nya di sini kita tinggal
copy saja nama-nama protein ini knoppers
ini kita copy sampai bawah kita copy
kemudian kita salin di notpad kemudian
satunya ini kita copy juga
kemudian kita salin di notpad ini
protein targetnya sudah ada di noted
semua
Oke kemudian semuanya kita blog kemudian
kita copy kemudian kita salin di kota
besoknya mesin kontrol V setelah itu di
sini ada organism ini ada tanda panah
kebawah tanda panah ini kita klik ini
ada les organismenya kita pilih
homosapiens kita klik kiri sekali
kemudian kita Scroll ke arah bawah di
sini ada tombol kita klik kiri sekali
kemudian ada tombol kita klik kiri
sekali lagi kita tunggu sebentar Maka
akan muncul daftar list protein yang
kita masukkan dari
kemudian kita Klik tombol continue untuk
mendapatkan map dari interaksi
protein-protein target yang dapat
berinteraksi dengan
si kurkumin saat ini ada banyak ya oke
kemudian tadi fokus kita adalah kita
ingin mengkaji potensi sikur comment
terhadap
anti sebagai antikanker atau sebagai
obat untuk mengobati kanker Oleh karena
itu kita perlu menentukan dari berbagai
protein target ini manakah protein yang
akan kita tindaklanjuti sebagai protein
yang akan dianalisis di tahapan
selanjutnya ada beberapa cara yang
pertama adalah dengan melihat protein
ini satu persatu protein yang dihasilkan
dari tiga website awal tadi kita cari go
silase ini apakah berkaitan dengan
kanker atau tidak wagelase faktor
berkaitan dengan tidak dan sebagainya
Nah kalau kita lihat di sini ya Nah ini
misalkan epidermal growth Factor
receptor iarbi by one ini dulu saya
pernah belajar ini di bab kinetik
control of cell Division Hai jadinya
kontrol genetik pembelahan sel
bahwasanya epidermal growth Factor
receptor ini terlibat juga dalam
pembentukan kanker ketika dia mengalami
mutasi maka saya bisa menentukan Oke pot
protein yang akan saya tindak lanjuti
dalam analisis informasi ke dalam
pengujian saya adalah yang RBB
langkah pertama Elang alternatif
penentuan protein kaget seperti itu kita
lihat jenis proteinnya kemudian kita
cari manakah protein yang terlibat dalam
penyakit yang kita inginkan tadi
misalkan Anda penyakitnya masih porosis
nanti protein target dari senyawa alami
yang telah Dapil ada banyak maka coba
identifikasi mana sih protein target
yang memang terlibat dalam osteoporosis
pilih salah satu begitu ya kemudian keep
nama itu simpan nama itu sebagai dasar
anda melakukan analisis selanjutnya itu
alternatif-alternatif kedua telah kita
menggunakan bantuan sering DB Nah kalau
kita lihat ini Kan mapping interaksi
proteinnya tapi kalau kita Scroll Kara
bawah nah disini ada berbagai tabel kita
cari yang GG pathway
nah disini
ini Eiger tirosin kinase ini
bisa kita lihat ya
ad-dari GG baterainya ada berbagai pas
gue yang bisa kita pilih misalkan kanker
Kanker itu perlunya ada beberapa
misalkan ini ada prostate Cancer ada
eggs tirosinase kinase inhibitors
kebetulan karena tadi saya memilih
erbb2 dan RB dewan itu berkaitan erat
dengan
egfr
RB wanita termasuk ini saya
makai ini akan muncul karena merah
setelah saya klik ok Kyle merah egfr ini
tombol merahnya muncul ketika saya ke
atas
maka yang berkaitan dengan ighfir
tersebut akan berwarna merah semua dan
ini bisa kita tarik biar jelas nah ini
nah gfr akan berwarna merah dan protein
yang berinteraksi dekat dengan kefir
juga akan berwarna merah nah Gambar ini
ini yang menjadi data kita ya yang bisa
kita laporkan juga di pepper yang kita
sesuai
selanjutnya adalah kita menyiapkan
struktur tiga dimensi dari pintar get
yang telah kita pilih tadi misalkan tadi
saya pilih RB one maka langkah
selanjutnya adalah saya menyiapkan
struktur tiga dimensi dari RW Bagaimana
caranya akan saya jelaskan di video
selanjutnya terima kasih atas
perhatiannya Assalamualaikum
warahmatullahi wabarakatuh