Drug Similarity, Pharmacochemical, Physicochemical, and Toxicity Analysis of Candidate Drug Natur...
HGdecdXqBtQ • 2022-07-29
Transcript preview
Open
Kind: captions Language: id Halo assalamualaikum warahmatullahi wabarokatuh berjumpa lagi dengan saya di channel YouTube saya ensiklopedia Ahmad Fauzi di video Sebelumnya kita telah mempelajari bagaimana caranya melakukan molekular Doki di video tersebut kita juga telah mempelajari bagaimana caranya memvisualisasikan hasil molecular docking secara tiga dimensi seperti ini ataupun secara dua dimensi seperti ini dan pada video kali ini Mari kita pelajari Bagaimana caranya menganalisis senyawa kimia yang kita miliki tadi untuk dianalisis kemiripan obatnya kemudian farmakokinetiknya sifat-sifat fisikokimianya hingga uji toksisitas pada senyawa alami tersebut oke langsung saja kita mulai kita bisa memprediksi berbagai sifat tersebut dengan bantuan webserver salah satu webserver yang sangat berguna adalah swissadme sehingga kita bisa ke Google kemudian menuliskan swissadme seperti Hai kemudian kita pilih swissadme yang alamatnya seperti trisakti.com udian ini merupakan tampilan website Which May tersebut Nah di sini kita bisa memasukkan Smash dari senyawa alami yang kita kiri di beberapa video sebelumnya ini akan canonical Smash yang bisa kita copy kemudian kita salin di kota ini kemudian di sini ada tombol orang bisa kita klik Hai sehingga molekul kita ini akan diproses diprediksi dianalisis sifat-sifat fisikokimianya farmakokinetiknya drag lightness nya dan sebagainya nah ini hasilnya ini struktur dua dimensi dari senyawa alami kita di itu kurkumin kemudian ini Radar bioavailability ini bagus sekali ini ilustrasinya dan ini bisa kita tampilkan juga pergi ta naradar bioavailability menggambarkan bagaimana sifat dari senyawa yang kita Uji tadi dengan menggunakan enam indikator ini kita lihat ya secara lebih besar darinya indikator lipofilisitas nya ukurannya polaritasnya kemudian solubilitas nya saturasinya Hingga fleksibilitasnya obat dikata kemonas kandidat obat senyawa alami dikatakan bagus dan mirip obat Villa dia berada di daerah berwarna pink Oh ya kalau daerahnya hasil pengukurannya berada di dalam warna pink ini artinya senyawa alami kita bagus dan cocok digunakan sebagai kandidat obat nah hasil pengukuran dari senyawa alami kita ditunjukkan oleh bintik dan garis merah ini Nah bisa kita lihat ya ternyata senyawa alami kurkumin bila kita analisis menggunakan bantuan siswi sakne ini memiliki hasil yang sebetulnya bagus ya di di fleksibilitasnya titiknya di sini diri punya disini size-nya disini polaritasnya disini sogili tasnya disini saya nya di saturasinya Dia sedikit diluar dari daerah warna merah ini begitu jadinya secara umum berdasarkan dari ini dia lemahnya hanya di satu parameter ini jatuh Kemudian dari swissadme ini kita juga bisa melihat berbagai hasil-hasil dari prediksi sifat fisikokimia nya kemudian lipofilisitas nya kemudian bagaimana dia terlalu airnya farmakokinetiknya drakness kemiripan dengan obat dan Medina medicinal chemistry kita lihat satu persatu secara Kavling pertama di sini sifat-sifat fisiko kimia sifat-sifat fisiko kimia adalah semacam karakteristik fisika dan kimia dari suatu molekul di sini bisa kita lihat formulanya seperti ini kemudian molekular webnya massa molekular nya sebesar ini dia masih bagus karena dibawah 500 ya kemudian sini ada berbagai parameter lain yang penting yang nanti akan kita baca di seks selanjutnya di di bagian selanjutnya kita langsung lanjut yang mana ya yang gini lipofilisitas lipofilisitas ini berkaitan dengan suatu senyawa Apakah dia terlarut pada secawang nonpolar dan dikit atau tidak yang bisa kita baca salah satunya di sini dari love-love nya dibawah 5 itu termasuk senyawa yang bagus untuk dijadikan begitu kemudian Oke kita sifat fisikokimia lagi di sini ada Mr Mr molar refractivity ini berkaitan dengan polarisasi dari molekul tersebut ya oke kemudian disini adalah di water-soluble itiknya kelarutannya terhadap air ketika kita menganalisis senyawa alami kandidat obat kelarutan air itu penting karena tingkat kelarutan air itu berkaitan dengan Bagaimana penanganan zat itu ketika dijadikan obat bagaimana absorpsinya ketika dia menjadi oral Draco obat yang lewat mulut ya kemudian berkaitan juga dengan Bagaimana penanganan dan formulasi dari kabinet obat itu ketika akan dijadikan obat begitu kemudian Disini yang penting Hai namaku kinetik nah ini ada berbagai parameter yang penting ini karena aku kinetik itu apa secara sederhana farmakokinetik itu berkaitan dengan head berkaitan dengan apa yang terjadi pada obat tersebut ketika masuk ke dalam tubuh secara umum kalau kita belajar farmakokinetik ada empat parameter utama yang bisa disingkat sebagai admin itu absen penyerapan kemudian D itu distribusi Bagaimana distribusi senyawa tersebut di dalam tubuh kemudian m itu metabolism bagaimana senyawa tersebut dimetabolisme dan itu expression Bagaimana senyawa itu dikeluarkan di sini ada gi absen gi tugas intestinal alias saluran pencernaan Jadinya bagaimana senyawa itu diabsorpsi di intestinal kalau Hai jadinya tinggi jadinya dia bisa mudah diserap jadinya bagus kemudian di sini ada terlebih-lebih ini bro Larry permian itu bagaimana dia bisa menembus atau tidak Apakah Kenapa kok suatu senyawa kandidat obat perlu diukur Rivaldi permennya nah ini penting kalau senyawa tersebut kita jadikan kandidat obat untuk mengobati yang target selnya itu sistem saraf pusat di otak jadinya BB permen ini berkaitan dengan kemampuan obat untuk tembus ke DNS Central nervous system ke sistem saraf pusat dan otak disini hasilnya Ternyata dia tidak bisa ya tidak bisa tembus kemudian disini pijit glikoprotein permeability jadinya Apakah dia menjadi substrat atau tidak pada PGP ini ternyata dia tidak kemudian ini saya penis welcome p54 itu penting karena ini enzim-enzim ini berkaitan 27 fungsinya Itu untuk biotransformasi obat ini ketika obat masuk sel itu kan nanti suatu saat ditransformasi harus diubah bahaya nanti ya kalau menumpuk dan sebagai kemudian senyawa kita dites Apakah dia malah bisa menggambar cp450 menghambat ya Ternyata ini sebagian besar no ya tapi ada dua sihir yang ternyata Yes kemudian klok klok care permeation ini berkaitan dengan penyerapan senyawa itu pada kulit misalkan kita ingin membuat kandidat obat dan obat itu administrasinya lewat kulit bukan lewat orang mereka skin permeation ini bermekaran m yang penting semakin minus angkanya semakin sulit dia bisa tembus ke kulit begitu kemudian ini parameter berhak lightness kemiripan obat Bagaimana suatu obat itu suatu senyawa obat tuh mirip dengan obat pada umumnya udah dinamakan gerak lightness Nah ada berbagai rule ada berbagai panduan yang bisa digunakan untuk menentukan suatu senyawa alami bisa menjadi kandidat obat yang baik atau tidak salah satu aturannya ada lift inspirol lebih lengkapnya namanya Levis Philippines Choirul office Nah itu berisikan pengaturan 4 panduan yang bisa kita jadikan dasar apakah suatu senyawa alami akan bagus menjadi oral zat jadi oral Zaid menjadi gerak yang bisa dimasukkan ya oral ada 4 yang pertama karakteristiknya donor donor atom donor hidrogennya itu kurang dalil dari lima kemudian jumlah atom aseptor ikatan hidrogennya itu kurang dari 10 kemudian molekular wc-nya kurang dari 500 dan yang terakhir adalah lopenya lipofilisitas nya kurang dari 5 tadi dikatakan lips Irul office Kenapa karena tadi angka-angka tadi semuanya kelipatan 5 semua Nah di sini sesuai dengan dia jadinya dia tidak ada pelanggaran Bisa dicek disini properti jumlah Bona sektornya ya itu tidak boleh lebih dari 10 ini cuma enam kemudian donor ikatan hidrogennya kurang dari 5 disini betul2 kemudian molekular wes nya ini digantung delapan kurang dari 500 kemudian lipofilisitas nyalo Kenya kurang dari 5 3,2 sehingga sesuai Little roo roo yang lain juga ada rulenya kursi ini juga aman kefir juga aman Agan juga mungkin juga ama kemudian disini adalah bioavailability scordia 0,55 kemudian yang terakhir misteri di sini ada empat parameter yang pertama fans-fans ini penting ketika kita mencari kandidat obat fans itu digunakan untuk melihat keberadaan Adakah keberadaan positivos itu semacam itu ya senyawa yang bisa menipu kita senyawa aktif yang hasilnya nya berpotensi sebagai obat ternyata dia Hanya menipu begitu sederhananya seperti itu jadinya menghasilkan hasil positif artinya kemudian breng-breng ada daftar 100-105 senyawa 105 senyawa yang diindikasikan berbahaya kemudian bisa mempengaruhi metabolisme dan sebagainya dan disini ternyata berdasarkan daftar list 105 senyawa itu ada dua alat yaitu kemungkinan hamil jadi beda ketua anhidrat dan michael aseptor satu kemudian Lex lightness lightness itu kayak brackley itu secara sederhana seberapa bagus sih senyawa alami akan menjadi obat disini ternyata tidak terpenuhi tidak seperti di sini kalau dihiasi Nino Kenapa karena melanggar dua film ini lebih dari 350 Jadinya kalau dari dari senyawa obat itu sebaiknya di bawah 3 50 beda sama lipinski tadi kurang dari 50 Kalau katanya lipinski kemudian disini rotornya lebih dari tujuh begitu kemudian yang terakhir ini juga accessibility bagaimana dia suatu senyawa alami itu bisa disini bisa dihasilkan secara sintetik skornya berapa ternyata disini dikatakan hasil analisisnya 2097 artinya apa Nah ini sini ada keterangannya satu itu sangat mudah di sintetik kan sedangkan 10 itu sangat sulit nah disini 297 lebih mendekati angka 1 ya oke kemudian ini Ini hasilnya gambar Ini penting angka-angka ini penting dilaporkan kemudian kita sudah menganalisis ini memprediksi sifat fisikokimia tasnya kelarutannya dalam air farmakokinetiknya kemudian paint spring lightness hingga sekarang waktunya kita untuk menguji toksisitasnya apakah senyawa alami kita itu bisa menjadi toksik ketika masuk ke dalam tubuh kita menggunakan webserver yang lain namanya protalk sorry protox Nah seperti ini ya kita tulis kita klik kemudian kita tunggu sehingga kita diarahkan ke website dari produk tersebut kemudian kita pilih ini talks prediction bisa kita klik kiri bisa kita bisa juga kita Klik Kanan saya coba Klik Kanan kemudian open link In New tab nah ini halamannya halaman dari talks prediction pada produk kemudian kita bisa memasukkan nama senyawa alami kita misalkan kurkumin atau kita Ismail sejalan dengan berbagai analisis yang telah kita lakukan kita copy smilenya saja kemudian kita pesqueira salin disini kemudian kita Klik tombol smile kita tunggu sebentar sehingga struktur dua dimensi dari senyawa alami kita muncul di sini baru setelah itu di sini ada berbagai parameter bisa kita tentang tergantung senyawa kita ini mau kita fokuskan analisis toksisitasnya ada apa Hai misalkan kita ingin centang hepatotoksisitas jadinya toksisitasnya terhadap Eropa kemudian karsinogen etiknya wa Apakah dia diprediksi bisa jadi agen Casino agen Casino agen penyebab kanker immunotec disita sebagaimana pada sistem imunnya dia Toxic Muttaqin mutagenicity Apakah dia bisa menjadi mutagen bisa menyebabkan mutasi pada asam nukleat materi genetik kemudian sitotoksisitas Siapakah dia beracun pada sel bisa merusak sel-sel kan kemudian ini juga bisa dicentang apa kalau mau dicentang silahkan kalau ini dicentang semua bisa Klik di sini begitu ya sementara kita pakai ini saja dulu kemudian baru kita crichq Edition kemudian kita tunggu nah ini hasilnya ini struktur dua dimensi dari kurkumin kemudian Ini hasilnya Anda banyak ini bagus kali ini kita menggunakan protes berbagai bisa kita peroleh berkaitan dengan toksisitas dari senyawa alami kita disini awalnya ada hasil prediktif LD50 LD50 itu secara sederhana bisa kita lihat di sini l50t media artinya Lethal Dose median nilai Tengah dari Maksudnya gimana yaitu ketawa dosis ketika 50% subtitle dites dengan dosis tersebut akan mati begitu jadinya Lethal Dose sebesar 2000 MG per kg berat badan kemudian prediksi Dia kelas Maksudnya apa kita kembali lagi ke halaman utama terjadinya toksisitas dari suatu senyawa bisa dibagi menjadi enam dari kelas 1 hingga kelas 6 kelas 6 itu non-toxic Sedangkan Bila tertelan nah ini sesuai hasil ternyata dia kelas 4 bisa kita lihat Disini empat itu berbahaya bila tertelan Kenapa karena LD50 nya itu lebih besar dari tiga ribu tapi tidak sampai ta2003 Avanza lebih ponsel Sorry ya LD50 nya lebih besar dari 300 sehingga 2000 kita di kita lihat LD50 senyawa ini 2000 jadinya dia perbatasan di kelas 4 SD dia 2000 Lebih dikit gitu ya dia sudah kelas 5 Lebih aman lagi begitu kemudian disini muncul juga ya fisikokimianya tidak perlu kita baca-baca menggunakan sisa yang lebih lengkap bisa kita lihat toksik terhadap organ khususnya ke menggunakan hepatotoksisitas ternyata dia inaktif jadinya lama kemudian Apakah dia karsinogen ternyata inaktif diam nah ini yang perlu menjadi perhatian ketika mau paint World of visiting ternyata dia artis begitu ini perlu diprediksi dianalisis lebih lanjut kalau Muttaqin isinya dia aman tidak mutagen tasnya nah kemudian mana yang bisa kita tampilkan kita selain melaporkan LD50 kemudian toksisitas kelas kita juga bisa menggunakan Radar di bawah ini kita klik ya biar radarnya besar nah ini Radar Ini penting ini bisa kita bisa kita jadikan bahan untuk dilaporkan di paper yang bagus itu sewaktu senyawa kalau hasilnya di dalam zona orangnya ini namun ada parameter yang yang kurang bagus maka dia akan diberi warna biru kemudian diluar zona-zona orangnya Ini contohnya iaimnu toksisitasnya aktif di sini dia warnanya biru misalkan ada lebih dari satu parameter yang uh yang hasilnya kurang bagus makan nanti birunya lebih dari satu kemudian dia akan membentuk semacam jaring seperti ini akan membentuk kayak semacam penutup biru di atasnya orang begitu tapi ini Kebetulan yang biru cuma satu sehingga tidak membentuk daerah yang saya maksud begitu ya bagaimana caranya kita memprediksi kemiripan farmakokinetik sifat kimia dari senyawa alami dan obat yang kita angkat dalam analisis Informatika terima kasih atas perhatiannya Mohon maaf bila ada kesalahan Assalamualaikum warahmatullahi
Resume
Categories